تفاوت اصلی برج خنک کننده کانتر فلو(جریان مخالف) و برج خنک کن کراس فلو(جریان متقاطع) در نوع جهت یا مسیر گردش آب و هوای کولینگ تاور(cooling tower) می‌باشد. در برج کراس فلو جریان آب به صورت عمودی از بالای دستگاه در حال ریزش است که با جهت عبور هوا در مسیر افقی با زاویه‌ی 90 درجه برخورد می‌کند
